Článek
Na vrcholu své kariéry vyhrál Botero na Tour i tři etapy a v celkovém hodnocení v roce 2002 skončil čtvrtý. Před čtyřmi roky se jeho jméno objevilo na seznamu jezdců podezřelých z dopingu v takzvané Operaci Puerto. Botero kvůli tomu přišel o angažmá v elitní stáji Phonak.
I když ho národní federace později očistila, do světové špičky už se nevrátil a úspěchy sbíral především ve své vlasti.